這是最早記述雨花石
的石譜。
南宋末年，大收藏家周密也記載了他喜愛雨花石的經過，對於雨花石珍品水膽雨花空青石作了最早的描述：“經三寸許，撼之其中，有聲汩汩然，蓋中虛有在內故也。”由此可見，在南宋雨花石已經成為人們眼中的奇珍而被關注。
明太祖朱元璋60歲壽辰時，寵孫朱允炆在盤子中用雨花石拚成“萬壽無疆”4個大字，連同一個酷似壽桃的雨花石，作為祝壽之禮和盤托出，皇親國戚、文武百官無不稱奇，使龍顏大悅。
朱允炆稱帝後，對雨花石仍情有獨鍾，內宮案頭，時有雨花石供品。
明代書法家米萬鍾，字友石，又字仲詔，自號石隱庵居士。米萬鍾為宋代大書法家米芾後裔，一生好石，尤擅書畫，
晚明時與董其昌有“南董北
米”之稱。
米萬鍾於1595年考中進士，次年任六合知縣。米萬鍾對五彩繽紛的雨花石歎為奇觀，於是懸高價索取精妙。當地百姓投其所好爭相獻石，一時間多有奇石彙於米萬鍾之手。
米萬鍾所收藏的雨花石貯滿了大大小小各種容器。常於“衙齋孤賞，自品題，終日不倦。”其中絕佳寶石有“廬山瀑布”、“藻荇縱橫”、“萬斛珠璣”、“三山半落青天外”、“門對寒流雪滿山”等美名。並請吳文仲畫作《靈岩石圖》，胥子勉寫序成文《靈山石子圖說》。
米萬鍾對雨花石的鑒賞與宣傳，貢獻良多。米萬鍾愛石，有“石癡”之稱。他一生走過許多地方，向以收藏精致小巧奇石著稱。
其後，林有麟對雨花石的研究也很有成就，所著《素圓石譜》精選35枚悉心繪製成圖，一一題以佳名。林有麟在素園建有“玄池館”專供藏石，將江南三吳各種地貌的奇石都收集置於館中，時常賞玩。
朋友何士抑送給林有麟雨花石若幹枚，他將其置於“青蓮舫”中，反複賞玩，還逐一繪畫圖形、品銘題詠，附在《素園石譜》之末，以“青蓮綺石”命名之。
雨花石名真正脫穎而出在明末清初，徐榮以《雨花石》為題寫了一首七律詩；張岱在《雨花石銘》一文中稱：“大父收藏雨花石，自餘祖、餘叔及餘，積三代而得13枚……”
再後，薑二酉也是熱心收藏雨花石的大家。薑二酉本名薑紹書，明末清初藏書家、學者，字二酉，號晏如居士。
隨著中外交流日益頻繁，明代已經能夠經常見到西洋的人了，於是薑二酉所藏雨花石也有起名如“西方美人”，此石長1.5寸，寬0.8寸，色草黃橢圓形而扁。上有西洋美女首形，頭戴帽一頂，兩肩如削，下束修裙，細腰美頰，豐胸凹腹，體態輕盈，人形全為黑色。
再如雨花石精品“暗香疏影”，石為圓形，質地嫩黃，溫潤淡雅，上有綠色枝條斜生石麵，枝上粉紅花紋繞之，鮮潤豔麗，如同一樹梅花，頗具詩意。
還有神秘色彩的雨花“太極圖”，該石為球狀，黑白分明，界為曲形，成為一幅極規範的太極圖。
薑紹書之祖養訥公，是石雲孫之甥，曾與石雲到古舊物市場，見一圓石瑩潤精彩，搖一下聽聲好似空心，石雲以為是璞玉，買回後請
人剖開。一看裏麵是一天成太極圖，黑白分明，陰陽互位，邊緣還環繞著如霞般的紅線。而取名“雲翔白鶴”的雨花石，則石質淡灰如雲，雲端中躍然一隻白鶴，其翱翔神態栩栩如生。另外，極具生活情趣的“鬆鼠葡萄”，石做腰子形，色醬黃，中有黑色鬆鼠一隻，翹著尾巴，正在吃一串葡萄。“梅蘭竹菊”為4枚雨花石，梅石疏影橫斜；蘭石幽芳吐馥；竹石抱虛傳翠；菊石傲霜迎風。四石各具其妙。不可再得的“貓鳥雙棲”石，上部有二鳥棲於枝頭，下有雙貓相對而伏，神采奕奕。神奇孤品“老龜雛鵝”，此石黑質白章，一麵為伸頸老龜之大像，一麵是一隻天真的小鵝雛。
清代《西遊記》小說與京劇開始流傳，所以有的雨花石就命名為“悟空龐”，色如豇豆，上有一元寶形曲線且凸出石表，在曲線正中偏上處恰又生出兩個平列的小白圈，圈內仍是豇豆紅色，極似京劇舞台上的孫悟空臉譜。
清乾隆帝在位61年，曾6次南巡，南京乃必到之地。以雨花台為題
的詩便有5首，如《雨花台口號》、《戲題雨花台》等；在莫愁湖畔的景觀石上刻有他“頑石莫嗤形貌醜，媧皇曾用補天功”的詩句。
乾隆皇帝十分珍
愛的有4枚雨花石。其中一枚龍首畢現，出神入化，令人稱奇，名為“真龍天子”。