在福州地區，有人采取腐爛法去皮。將根木放在活水中或埋在泥土中4~6個月，可使根皮腐爛，並能防止裂紋、蟲蛀。浸泡時要注意翻動檢查。浸泡時間的長短，以根皮腐爛到可以脫落為止。
濕皮去掉後，放到陰涼處陰幹即可。一定要注意不可在陽光下曝曬。陰幹後的根材紋理清晰，木質色彩美觀。
4.根材防菌防蟲。
在根藝創作和製作中，要注意防止根木材料在抵抗物理、化學以及生物等因素的作用中可能受到的損害，使其在較長時間內保持自身的天然性能和表麵形態之美。
根藝作品能否保存久遠，取決於根材自身的腐朽因素和根藝作品的製作條件。根藝作品在良好的條件下製作，可能保持數千年，而在不良條件下製作，幾個月即可損壞。
5.根藝作品上色。
根藝作品在製作工藝處理上，大多比較重視上色，使其光怪陸離，多姿多彩。常用的有棕色、黃褐色、梧桐樹皮色、仿紅木色、仿古董色和原木色等，根藝作品上色，常見的有三種方法：一是補色法，二是仿古上色法，三是保持自然色。
（1）補色法。有一些根木由於受真菌的侵害，或化學、物理等因素的影響，表麵顏色變得有深有淺，在製作根藝作品時，應適當加以補色，使顏色統一。
還有的根木出現病態，長出許多較深顏色的斑點，這是遭受蟲害所致，需要除斑補色。補色顏料種類很多，天然礦質顏料、化學顏料（即繪畫顏料或工業染料）都可運用。具體補色時，要仿照根木本身色澤的深淺，將顏色調製適合後再往上補。
（2）仿古上色法。中國的仿古根藝作品，早期出於北京、浙江和福建一帶。根藝仿古上色，一般要根據根材木質堅韌程度、幹濕程度的不同，用色的多少以及上色的方法也不同，要因材施色。
在用色上，一般都是以茶褐色為基調運用色調的深淺明暗變化，構成根藝作品的古樸色調，在顏料的選擇上，也要因材而異，過去多用天然顏料，即礦質顏料。
現在有的根藝作者用“紅樹皮”搗碎煎熬出濃汁，當作仿古色，有一種自然美的古樸味。也有人利用現代化學顏料，如中國畫顏料、水彩顏料或工業上使用的染料以及木質家具使用的顏料等等，經過調配後使用。無論使用什麼顏料，隻要達到仿古色效果，達到作者的仿古表現要求即可。
（3）保持自然色。一件根藝作品在製作工藝處理時，是上色，還是保持自然色，要因材而定。如果這件作品的根材色澤很好看，紋理清新，就應當保持自然色，不必另上顏色，否則會弄巧成拙。
按照作者的創作要求，進行嚴格的工藝處理，是為了讓自然色體現得更充分，更完美。如在局部作適當補色，以彌補作品根材顏色的某些缺陷和不一致。另外，在上漆或燙蠟時，應注意選擇無色的漆和蠟，使根材的木質紋理清晰可見。