但是，基於相同之外，兩個問題引起了爭議。第一，日本堅決不轉讓包括轉向架、牽引電力動車、控製係統等方麵的核心技術，中國隻能租；第二，日本人的開價，對當時的中國來說，確實太高。
談判的情況對中國越來越不利。不是我們不會談判，實在是手上沒好牌。根據日方專家回憶，那一輪談判，最後日本人幾乎是完勝的局麵。在簽了幾個實驗性項目、證明日方技術適用於中國以後，中國方麵幾乎就要麵對霸王條款簽字了。
要是那樣，高鐵最快也就能跑300公裏，這也是日本新幹線今天的速度。可如今，我們高鐵的平均速度是350公裏每小時，而且留下了繼續提速的空間。 原來，就在簽約在即的時候，一個意外發生了。
說是中日雙方談判裏麵，有一位很支持簽合同的中方副部長。這位副部長的態度和受賄沒關係，就是對新幹線欣賞有加。談判快成了，副部長說再坐趟新幹線，感受一下。日方要安排，副部長說，不要，我就買票，體驗日本普通人的乘車生活。
一路登車看景，賓主盡歡。
車行至名古屋，上來一位日本媽媽帶著個小孩子，坐在副部長對麵。副部長喜歡孩子，自然習慣性地摸頭摸腦，誇讚幾聲。但日本不流行這個。所以對麵那個媽媽就有點兒不自然，又聽他說話是外國人，麵孔越發繃起來。這樣過了一會，那位母親說孩子的玩具不見了，並且告訴列車員懷疑是對麵那個中國老頭拿走的。
日方陪同人員臉色大變，連連解釋說不可能，那位母親一口咬定，要叫警察來搜。副部長開始還聽不明白，後來就明白過來，臉色也是大變。那位母親還真把警察找來了，結果自然和副部長無關。
副部長回國後，說新中國成立都30年了，還那樣歧視華人，是可忍孰不可忍。從此沒再給新幹線說過好話。而據說那對母子等警察走後，卻也神秘地不見了。整個事件撲朔迷離。但日方當時的陪同人員後來說，這段故事演繹的成分居多。
其實，真正造成新幹線購買計劃拖延的原因很多，其中一個重要原因，就是中日關係發生了劇變。日本把幾個甲級戰犯挪進靖國神社，然後首相去參拜，結果導致中國民間反日情緒高漲。
這一來，中方鐵道部的人告訴日方，說這買賣不能做了——我們要考慮政治影響。日方想了想，發現也隻能如此。
可眼看雙方就要告別，日本代表忽然唱起了國際共產主義，說，我們都是親華派，和參拜的混蛋不是一路。要不這樣吧，咱們還是保留技術合作，我們無償支援你們一些技術項目吧——當然，關鍵的咱們還是不能轉讓，隻能是一些邊緣技術。
中方也十分感動，說，好啊，你們要來人，食宿算是我們的。雙方灑淚而別，一幅動人的場麵。