1.2.5 完成各類臨時性工作
保證醫院各種政令及工作的貫徹實施專科經營助理除完成日常運營管理工作外，還需完成醫院其他臨時性工作。如醫院組織架構的改造，醫院空間、流程再造；醫院信息化建設，醫院規範化製度的建立等。
所以專科經營助理的素質很高，應該由院長直接管理，醫院有新項目開展，購買新的設備都可以要科室助理先做調研，寫出分析讓領導決策。當然許多工作也需要醫院其他科室幫忙，但是科室助理的機動性很強，可以隨時調配，放到項目組工作還是很有優勢。
2. 專科經營助理麵臨的挑戰
專科經營助理是醫院所需要的，但是衛生係統在機構設置的時候沒有要求醫院一定設置運營管理辦公室或科室專科助理辦，科室助理應該屬於醫院院長直接管理，目前許多醫院還沒有此意識，所以麵臨著幾個方麵的挑戰：
2.1 組織層麵
崗位設置在國內公立醫院沒有硬性要求，可設可不設，相對來說科室助理的職責和使命沒有統一。崗位職能可能與現有醫院的醫務處、財務處和科教處等行政管理科室在職能上產生一定的重疊，請示彙報與溝通存在一定問題，權利有重疊之處。臨床科室由以前的管理模式轉為更加職業化管理，這可能會引起觀念上的衝突，科室人員觀點改變還需要一段時間，特別是執行力方麵，與企業接軌，執行力很強，科室員工也是企業化管理。
2.2 個人層麵
專科經營助理需要平衡與協調醫院戰略目標與科室利益之間關係，甚至科室人員的利益也要涉及，如何讓幾方共贏，這對專科經營助理的管理知識背景與協調能力提出了挑戰，特別是財務知識和市場開拓能力非常重要，許多人不能勝任。
專科經營助理需具有運營分析、物料管理，設備管理，空間規劃，人事管理，績效管理，醫務管理等全麵的專業能力，這些能力短時間是達不到的，所以科室助理的培養會相對時間較長，個人要肯學習，肯鑽研，不斷在實踐中鍛煉，才能達到一名合格科室助理的要求。
綜上所述，專科經營助理對醫院的發展非常重要，作為醫院管理的一個崗位還處於探索發展階段，其職責還需在實踐中不斷完善，特別是在不同級別的醫院，科室助理的職能可能有少許不同，但是我們相信不久的將來專科經營助理會成為醫院不可缺少的管理崗位，幫助醫院提高效率，為醫院的發展做出貢獻。
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