然而有人提出了這樣的疑問：如果是物質不滅守恒，世界真的像是陳健的那樣隻是微粒的重新組合。那麼植物焚燒後可以產生碳酸氣、水。
那麼刨除掉空氣中氧氣的存在，可以證明植物中肯定有炭和氫，有沒有氧還不清楚。
氫很好解釋，植物生長要澆水嘛，不澆水植物就活不了，所以不管有沒有氧，氫的問題可以解決。
但是碳呢？碳從哪來的？
植物施肥，不需要施木炭。原本以為草木灰中含有植物的生靈所以可以促進植物的生長，但按照陳健的法施氯化鉀或是碳酸鉀有一樣的效果。所以排除掉草木灰中的碳的存在。
然後這個質疑的人將種植植物的沙土進行了加熱、燃燒，確定沙土中沒有碳的存在，加熱後澄清的石灰水沒有變渾濁。然後又將可以確定沒有碳的砂礫和配好的肥料進行了植株培養，這可以確保植物不會從根部獲得碳。
於是前兩派的反對者們都興奮起來，認為這件事徹底扭轉了局勢。陳健的那套體係明顯錯了，如果真的是物質不滅重新組合而且不可分之物不可轉化，那麼植物中的碳從何來？如果植物可以變出碳，是不是煉金術並不是沒有可能的？隻是大家沒有找到辦法？
然而想要搞修正的那一派卻主動幫陳健找出了這個實驗的漏洞，認為這個實驗沒有考慮到空氣中的碳酸氣的存在。
他們這一派大約明白陳健的這個體係隻怕內部是圓的上的，基本上沒辦法在邏輯上反駁。與其在直接推翻上浪費時間，還不如深入內部進行修正，他們可以承認物質不滅守恒，但卻可以找出生於死之間的鴻溝，從而完成在物質不滅前提下生靈或是人格靈魂這種神秘植物存在的概念。
不是瓦解，隻是修正。
第三支反對派的人不但設計了一個植物可以從空氣中獲取碳酸氣的實驗，還同樣驗證了一件事：植物在白吸收碳酸氣放出氧氣，晚上吸收氧氣排出碳酸氣。
在陳健的微粒體係之內提出了植物呼吸這一法，生動詳實而又不可反駁的實驗讓這個人獲得了很高的名聲。
獲得名聲後，他立刻開始修正陳健的那套體係。
既以陳健的支持者自居，又尊陳健為先生，卻又趁著陳健在海上不能回答寫了一篇洋洋灑灑的文章，要將陳健弄出的這套體係在世界觀上修正掉。
按照物質不滅的體係，地之初是否有生命都是無意義的，有也可以，沒有也可以，所謂生命隻是微粒的某種聚合。可能出現，也可能不出現，可以是必然也可以是偶然。
既然這樣，一切地人格論、靈魂論、生靈論、生死鴻溝論，都從世界觀上失去了統治地位。
這是很多人所不能接受的，而且是絕對不能接受的。
但是，如果物質不滅，但是生命從地初開之時就已經誕生、生者與無生機者之間有一條不可逾越的鴻溝，不管是人格、靈魂、萬物之靈等等，都可以變得和陳健的體係不矛盾。
的確，物質不滅，但生物死物之間有越不過去的鴻溝啊，物質的不滅的，可生命卻是早已注定的，生命屬於物質但又不同於物質，所以對人而言物質不是第一性。
生者之物高於無生之物，生者之物可以依據物質不滅理論拆分成一切，也可以將無生之物變為有生之物，但這個過程卻是不可逆的。之所以不可逆，那就是有某種神秘的、開辟地之初就存在的、和生命靈魂之類息息相關的東西。
基本上到了這時候，之前痛罵這人的反對派們才明白此人的良苦用心，頓覺可以互相扶持一起對抗陳健的體係，扭扭捏捏地承認了陳健的體係“或許有一定道理，但很顯然不完善”，大張旗鼓地為那個人站台。
往了看，這就是個屁事，或者隻是個化學或是植物學上的事。
但實際上，這是世界觀之爭，也是物質第一性和唯物無神論的化學基礎：物質與人格之間的創世之爭。人格到底有沒有生命的世界觀之爭。
一番造勢之後，那人用了陳健的那本《歸納總結和邏輯演繹》狂抽陳健的臉——如今還沒有任何實驗可以逾越生物與無生之物，所以他的法未必對也未必不對，但他不對是肯定不對的。你們不是講邏輯嗎？你們講邏輯就不能我的不對，除非你們真的創生。你們要是不講邏輯，那你們的一切體係都是錯誤的崩塌的。
這番修正與造勢的時候，陳健正在海上飄蕩，因而這大嘴巴子抽的啪啪響，卻沒人能反駁，造成了巨大的思想混亂。修正的東西最難反駁，而且看起來比之直接反對派更溫和也更無害，也更容易蠱惑更多的人，畢竟這理論還是承認物質不滅論的。