（二）事業單位績效工資的發放難以保障
通過國家的相關規定我們可以看出：本次事業單位績效工資改革新增了縣級的財政保障、省級財政統籌，中央財政適當補貼，其它事業單位是縣級財政與單位共同負擔。這項政策在沿海的省份可以實行，畢竟沿海的省份經濟相對發達些，但在中西部省份實行的難度會不小，有些縣級財政目前保工資發放就有難度，現在，事業單位又增加績效工資，這恐怕難以保障，有些需要縣級財政與事業單位自籌，恐怕最終會轉為全部要事業單位自籌，所一事業單位工資的發放有時候會難以得到保障。
三、創新我國事業單位績效工資改革的對策
（一）完善事業單位績效工資改革的製度建設
事業單位績效工資一方麵是事業單位體製改革的重要環節，同時也是改革收入分配製度的關鍵所在。因此，要想更好地完善事業單位績效工資改革，完善製度保障具有十分重要的意義。首先，完善事業單位績效工資的實施細則和大綱；其次，健全和完善相關法律法規建設，為績效工資改革提供重要的法律保障；再次，要自上而下構建科學的績效管理體係，這是績效工資實施的係統保障。
（二）構建科學的績效考核體係
首先，要積極完善事業單位的績效評價體係。在事業單位績效工資改革中，績效評價是績效工資製度的核心環節。隻有不斷完善績效評價體係，才能夠提高工作人員的積極性和主動性，真正起到約束和激勵作用。在事業單位工資改革中，要建立公平、公正、公開的原則，建立科學的評價體係，努力克服因評價體係不完善而造成的利益糾紛；其次，事業單位應該成立專門的績效考核委員會，強化績效考核的程序和結果。同時，積極完善利益申訴機製。如果工作人員發現考核結果不合理的時候，可以通過申訴來維護自己的合法權益。
（三）加強監督，強化事業單位績效工資實施的透明度
任何機製的正常運行都需要有相關部門監督，隻有這樣，才鞥夠保證製度的正常運行。當前，我國事業單位績效工資改革還處於探索時期，強化績效工資實施的透明度具有十分重要的意義。首先，要嚴格審批的程序，各地區要根據自身的實際情況製定績效工資細則，有專門的部門進行審核之後，才到財政部門進行備案；其次，加強對績效工資改革的檢查力度，加強檢查、審計、監督力度，對違紀違規現象及時查處和糾正；再次，加強社會對績效工資改革的監督。可以利用新聞媒體、網絡平台等形式接受社會的監督，保證事業單位績效工資改革的透明性。
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