拿破侖的寬容態度使一些王黨分子對他產生了幻想，他們紛紛給拿破侖上書，希望能與拿破侖合作，恢複波旁王朝。對此，拿破侖不屑一顧。
王黨分子還采取各種威逼利誘的手段收買拿破侖，拿破侖都不為所動。見此路行不通，王黨分子便決定采取極端方式——刺殺拿破侖。
1800年12月24日下午4時，日頭西斜，風和日麗。巴黎歌劇院安排演出海頓的清唱劇《創世紀》，拿破侖決定攜全家人去欣賞這部傑出的歌劇。
晚7時左右，拿破侖與拉納將軍等人一起乘馬車前往歌劇院。當他們來到聖尼凱斯大街中央時，為馬車開道的騎兵忽然發現路上有一輛手推車擋著，車上還用繩索結結實實地綁著一隻木桶。衛隊長便命令將手推車推到右側房簷下，讓拿破侖的馬車過去。
這時，拿破侖的馬車夫在後麵等得有點不耐煩了，便使勁揚鞭催馬，馬車快速向前奔去。當馬車還未走過200米時，裝滿炸藥和彈丸的桶“轟隆”一聲便炸開，當場炸死20餘人，傷60多人。拿破侖的車子也差一點被炸翻，車玻璃被炸得粉碎。所幸拿破侖和隨從人員平安無事。
爆炸案的發生讓不少人擔憂他們的第一執政王的生命安危，當然，也有人正在暗自偷笑，等待拿破侖身亡的消息。
而此時，拿破侖卻非常鎮靜地走進歌劇院的包廂。歌劇院的觀眾見拿破侖安然無恙地走進來，立刻全體起立歡呼：
“第一執政萬歲！”
當朱諾貼近他的耳邊彙報說，爆炸案是要謀殺他的，拿破侖用一種頗顯失望的語氣說：
“僅僅為殺掉一個人，就讓那麼多人死於非命，真是殘暴。”
拿破侖在包廂坐下後不久，清唱劇《創世紅》就開演了。但是，他並沒有看完這幕劇就離開了歌劇院，回到杜伊勒裏宮。
回來後，拿破侖才將一直忍住未發的怒火發泄出來。他高聲吼道：
“這是雅各賓派想暗殺我！他們是一群渾身汙穢不堪的地痞惡棍，他們同曆屆政府公開對抗。如果不能迫使他們就範，就必須把他們粉碎！”
幾天後，警務部便逮捕了設置爆炸裝置的肇事者，他們是卡杜達爾的特務，保王黨徒聖雷讓和卡爾邦。事實證明，雅各賓派被流放者謀殺第一執政是天大的冤枉，但拿破侖並未因此就赦免他們。
拿破侖的鐵腕統治很快就重建了法律的秩序，他的獨裁政權也逐漸為人民所接受。
（三）
在國內建立了比較穩定的局麵之後，拿破侖開始著手解決來自國外的第二次反法大同盟的威脅。此時，以英國為首的第二次反法同盟正在對法國形成包圍之勢。
拿破侖很清楚，法國此時需要和平的環境，需要有一個擺脫戰爭的喘息時機，但反法同盟顯然不會給法國這樣的機會。他們想用戰爭拖垮法蘭西，他們對拿破侖求和的回答是波旁王朝的複辟。英國首相威廉·皮特在下院猛烈攻擊拿破侖，表明與拿破侖勢不兩立。
反法同盟的幕後策劃者是英國，但英國隻出錢不出力，衝在反法同盟第一線充當打手的仍然是奧地利。在1799年時，法蘭西督政府將防守曼圖亞要塞的重任交給了拉圖爾·弗爾薩將軍，並授予他城防司令一直。不久，奧軍卷土重來，圍攻曼圖亞城。7月份，拉圖爾將軍在低擋不住的情況下被迫向奧軍投降，曼圖亞要塞又被奧軍奪回。
1800年4月，奧軍統帥梅拉斯將在薩沃納附近的法軍截為兩段，法國將領弗歇爾的部隊被迫退向尼斯，並被趕回瓦爾湖畔。另一支法軍馬塞納的部隊也被逼退到熱那亞要塞之內，這支法軍雖經馬塞納、蘇爾蒙等將領的奮力作戰，但還是低擋不住敵軍的猛烈進攻，處境十分危險。
拿破侖執政後，對奧軍的行為非常氣憤和心痛，他花了巨大代價才攻下的要塞居然又被敵人占領了。因此他執政後的第一步，就是著眼於恢複對奧地利的攻勢，重整東部邊境的軍隊。
盡管形勢對法軍很不利，但拿破侖還是從不利中看到了有利的條件。他一眼就看穿了奧地利軍隊大部分囤集在背靠中立國日內瓦的地區，那裏正是法軍可以從背後打擊的地方。因此，他將馬塞納作為自己整個戰役棋盤上的一部分，吸引奧軍圍困，牽製奧軍；而自己則率領一支新成立的“預備軍團”經瑞士的大聖伯納德山口，過阿爾卑斯山，直取奧軍的後方。與此同時，萊茵軍團將通過瑞士東部各州，切斷敵軍與奧地利本土的最後交通線。
這是個非常大膽而冒險的戰略計劃。為了保密，拿破侖再次展示出他示假隱真的本領，將他的參謀部和12個新兵團召集到第戎，以蒙蔽英國、奧國的間諜，而真正要作戰的部隊則通過不同途徑調赴日內瓦或洛桑。