城內的戰鬥整整的持續到夜間，由於私人武裝的強力抵抗，使得進入到城內的大唐士卒，在向王宮高句麗方向以及其他政府部門推進的時候，遇到了重重地阻隔，速度很難加快。
黃昏時分，李世民不顧手下百官的苦苦勸阻，進入到平壤城內。當得知軍隊推進速度緩慢的原因後，立即下令凡是遇到抵抗的私人府邸，一律殺其滿門，府邸內發現的財物盡數歸突入進去的士卒所有。而對於那些不曾抵抗的私人府邸，就先不要去打擾他們。這個命令下達下去以後，城內大唐士卒的推進速度，立刻有了明顯的提高。
夜半時分，高句麗的王宮在苦苦的抵抗了一整天以後，終於被大唐的士卒們攻陷。高句麗王高藏以及麾下眾多文武百官盡數被擒。
此時高句麗的莫離支蓋蘇文已經病死，一開始由他的長子，泉男生接替他的莫離支職位。泉男生已經在一年前交齊了贖金，並且離開了李恪的聊王府返回高句麗。但是此時他的勢力已經完全被他的二弟泉男建所吞並，麵對泉男建咄咄逼人的氣勢，無力反抗的他被迫將莫離支的位子讓出，自己則前往鴨綠江邊鎮守唐高邊境。李恪攻打鴨綠江邊的高句麗城池之時，他便主動放棄抵抗並痛快的投降於李恪。
李恪還是非常欣賞泉男生的作戰能力的，所以當泉男生主動放棄抵抗，並且投向於自己的時候，便把他提升為自己手下的一名將官。
至此，高句麗全境被平定。唐太宗李世民終於完成了自己在登基之初的夙願，徹底將高句麗剿滅。稍後，李世民下令將高句麗分為九個都督府、四十二州、一百縣。並於平壤設立安東都護府，有鑒於李恪手下的大將薛仁貴，在此番作戰當中非常之勇敢，率領三萬餘人便橫掃高句麗位於鴨綠江以南的四十多座城池，可謂是平定高句麗功高第一人，特晉升他為右威衛大將軍，並且出任安東都護府都護，統兵兩萬鎮守這裏。
李恪在此次對高句麗的戰鬥當中，雖然率領五萬大軍，沿著高句麗東海岸，一直打到高句麗與新羅的邊境。但是由於高句麗東部群山環繞，所以麵積雖廣卻並沒有多少城池，再加上他把攻打城池的任務，全部都交給隨同他出戰的程懷亮等將領，從而使得他本身在此次作戰當中，並沒有什麼閃光的亮點。
不過他已經不再去在乎這些個虛名，他如今已經是親王，手中所掌握的兵權，更是遠超其他的戍邊將領，已經到了封無可封的地步，除非李世民讓位於他，但是他又不肯接受。再說即便是沒有此番的戰鬥，他也早已經是戰功彪炳，足以青史留名，分出一些功勞給那些為自己四處的麾下將領作為對他們的獎勵，也是一件兩全其美的事情。
李世民又接受了李恪的建議，將高句麗的所有貴族，以及家中錢財超過五十貫的所有富戶，以及五十萬名百姓遷往大唐境內，並且分散於各道之內，最後又遷徙十萬十萬百姓到遼東。至此，高句麗境內所剩百姓已經十不取一
除夕終於來臨，李世民在高句麗王宮的大殿之上，宴請隨同自己出征的所有四品以上官員，就連負責鎮守百濟故地的劉仁軌等人，也來到了平壤城內，一通慶賀新年。