正文 DNA條形碼技術在常見中藥材蛇類鑒別中的應用(3 / 3)

目前,應用DNA條形碼技術鑒別中藥材已有很多報道,該技術極大地提高常見蛇藥材的鑒別方法和準確性,特別是對於那些經過炮製過的藥材樣品。由於COⅠ是位於線粒體上,屬於母係遺傳的基因片段,因此DNA條形碼僅依據一個基因片段難以實現所有物種的鑒定,自身存在一定缺陷,如雜交引起的基因滲入、線粒體基因向核內轉移的問題等。所以應用DNA條形碼在實際辨別藥材物種過程中,仍需結合形態學或輔以其他基因進行驗證。值得討論的是,DNA條形碼技術與利用形態手段分類方法在常見蛇類藥材科屬種水平的鑒定一致性略高(科水平50%、屬水平73.3%、種水平63.2%),這也限製了DNA條形碼在常見蛇類藥材鑒定中的應用範圍。此外,部分因樣本不足或者實在難以鑒別的藥材,最後可能需要依靠用多個基因片段來聯合分析。但無論如何,DNA條形碼技術仍然是一種快速有效和準確簡便的物種鑒別方法,極大程度地彌補傳統形態學分類方法的缺陷,代表了未來物種鑒別研究的發展趨勢,值得在中藥材鑒別中加大推廣應用和進一步深入研究。

[參考文獻]

[1] 秦秋.藥用動物真偽鑒別將有可靠依據,藥用動物DNA條形碼研究啟動[J].中醫藥管理雜誌,2010,18(9):819.

[2] Hebert P D, Cywinska A, Ball S L, et al. Biological identifications through DNA barcodes [J]. P Roy Soc Lond B Bio, 2003, 270:313.

[3] 崔麗娜,杜鶴,張輝,等.基於COⅠ條形碼序列的金錢白花蛇及其混偽品的DNA 分子鑒定[J].世界科學技術——中醫藥現代化,2011,13(2):424.

[4] 崔麗娜,杜鶴,張輝,等.基於COⅠ條形碼序列的龜甲及其混偽品的DNA 分子鑒定[J].吉林中醫藥, 2012,32(2):176.

[5] 胡嶸, 杜鶴, 崔麗娜, 等.海馬、海龍基於COⅠ條形碼的DNA 分子鑒定[J].吉林中醫藥,2012,32(3):272.

[6] 杜鶴,崔麗娜,張輝,等.鱉甲及其混偽品的DNA 分子鑒定[J].世界科學技術——中醫藥現代化,2011, 13(2): 429.

[7] Gu H F, Xia Y, Peng R, et al. Authentication of Chinese crude drug gecko by DNA barcoding [J]. Nat Prod Commun, 2011, 6(1):67.

[8] 杜鶴,崔麗娜,張輝,等.基於COⅠ序列的蛤殼及其混偽品的DNA 分子鑒定[J].吉林中醫藥,2012,32(1):55.

[9] 杜鶴,孫佳明,崔麗娜,等.基於COⅠ條形碼的麝香及其混偽品的DNA 分子鑒定[J].吉林中醫藥,2011,31(5):451.

[10] 杜鶴,崔麗娜,姚輝,等.基於COⅠ條形碼序列的珍珠母及其混偽品的DNA 分子鑒定[J].中國現代中藥,2011,13(11):12.

[11] 李丕鵬,王維勝,呂曉平.中國蛇類保護和利用概述:曆史、現狀和未來[J]. 沈陽師範大學學報:自然科學版, 2013,31(1): 129.

[12] 陳仁壽.淺析《本草綱目》蛇的藥用[J].南京中醫藥大學學報:自然科學版,2000,16(2):309.

[13] 中國藥典.一部[S]. 2010.

[14] 楊倉良. 動物本草[M]. 北京:中醫古籍出版社, 2001.

[15] 李軍德,黃璐琦,曲曉波. 中國藥用動物誌[M]. 2版.福州:福建科學技術出版社,2013.

[16] Wiens J J, Hutter C R, Mulcahy D G, et al. Resolving the phylogeny of lizards and snakes (Squamata) with extensive sampling of genes and species [J]. Biol Lett-UK, 2012, 8(6):1043.

[17] Folmer O M, Black W, Hoeh R. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I from metazoan invertebrates [J]. Molec Mar Biol Biotechnol, 1994, 3(5): 294.

[18] Hall T A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT [J]. Nucl Acids Symp Ser, 1999, 41: 95.

[19] Tamura K, Stecher G, Peterson D, et al. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0 [J]. Mol Biol Evol, 2013, 30: 2725.

[20] Kimura M. A simple method of estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences[J]. J Mol Evol, 1980, 16(2): 111.

[21] Nei M, Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics[M]. NewYork: Oxford University Press,2000.

[22] Posada D, Crandall K A. Selecting the best-fit model of nucleotide substitution[J]. Syst Biol, 2001, 50:580.

[23] Luo A, Qiao H, Zhang Y, et al. Performance of criteria for selecting evolutionary models in phylogenetics: a comprehensive study based on simulated datasets[J]. BMC Evol Biol, 2010, 10: 242.

[24] Darriba D, Taboada G L, Doallo R, et al. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing[J]. Nat Methods, 2012, 9(8):772.

[25] Saitou N, Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees[J]. Mol Biol Evol, 1988, 4:406.

[26] 崔誌偉,王康才,鄭暉,等. DNA條形碼序列對不同品種金銀花的鑒定[J].江蘇農業科學,2013, 41(8):43.

[27] 程新瑋,趙煥新,寧康,等.DNA條形碼技術在中藥質量評價中的研究進展[J].食品與藥品,2013,15(4):295.

[28] Avise J C. Phylogeography: the history and formation of species[M]. Cambridge: Harvard University Press, 2000.

[29] Cao S P, Guo L N, Luo H M, et al. Application of COⅠ barcode sequence for the identification of snake medicine (Zaocys)[J]. Mitochondrial DNA, 2014,23:1.

[責任編輯 呂冬梅]