諸葛亮的分析清楚透徹，說得孫權滿心歡喜，愁眉頓展，增強了他戰勝曹操的信心。但當時的孫權集團內部，主戰派與主降派的鬥爭非常激烈，尤其是主降派的代表人物張昭，在曹軍氣勢洶洶的威逼下，更是嚇破了膽，力主不戰而降，而當時主戰派的代表人物之一是周瑜，他正奉命去鄱（pó）陽調集水軍，不在柴桑，主降派的呼聲更是甚囂塵上甚囂塵上：原形容軍中作戰的倩況。後形容眾人議論紛紛。今多形容某種論調囂張。，這種情形，使孫權感到無所適從。
在魯肅的建議下，孫權迅速從鄱陽召回周瑜。周瑜回來之後，力排眾議，並信心十足地對孫權說：“請將軍給我精兵數萬，進屯夏口，我一定為將軍擊破曹操！”周瑜堅決抗曹的態度，感染了孫權，孫權下定決心迎擊曹操。在召開江東文武大臣的會議上，孫權毅然抽出寶劍，砍掉奏案上的一角，斬釘截鐵斬釘截鐵：比喻說話做事果斷堅決。地說：“如果有誰再敢說向曹操投降，就和這個木案一樣！”
在此期間，由於魯肅的引見，周瑜會見了諸葛亮。諸葛亮向周瑜提醒說：“孫將軍雖然下了決心，恐怕還有反複，因為此處主張投降的勢力還很大。依我之見，公瑾（周瑜字）還得再向孫將軍說說，主要是把曹軍兵馬多寡的實際情況再說清楚明白，讓孫將軍放心。”
周瑜很重視諸葛亮的意見，當天夜晚立即進見孫權說：“據諸葛先生了解，曹操所稱80萬水軍完全是恫嚇（dònɡhè）恫嚇：嚇唬。之詞，實際兵馬超不過20萬，並且已是疲憊不堪，而荊州降兵，對曹操尚存狐疑之心。這樣看來，曹軍人數雖多，一點兒也不可怕。隻要與劉備將軍聯合起來，打敗曹操是沒有問題的。”
周瑜一席話，更堅定了孫權抗擊曹操的決心。就這樣，孫、劉聯合抗曹的局麵正式形成了。
孫、劉聯盟的實現，是由當時的政治軍事鬥爭形勢所決定的。在敵強我弱的情況下，孫、劉聯盟是雙方與曹操爭存亡的共同願望。孫、吳聯盟局麵的出現，不能不歸功於諸葛亮、魯肅、周瑜的卓越識見。而諸葛亮在這關鍵時刻前往柴桑，向孫權反複陳說利害，促進了孫、劉聯盟的實現，這對戰爭的結果起了非常重要的作用。在出使柴桑、遊說吳主這場活動中，諸葛亮顯示了他作為一個政治家、軍事家的遠見卓識，也表現了他出色的外交才能。
孫權和劉備結盟後，他們的軍隊在赤壁（今湖北省蒲圻縣西北）大敗曹軍。這場戰爭的實踐，充分證明了諸葛亮、魯肅、周瑜等的分析和論斷是科學的、英明的。諸葛亮在赤壁大戰前後，還有過哪些活動，史書上沒有記載，因而無法查考。但作為劉備一方的主要決策人物諸葛亮，他不可能不參與一些聯軍作戰問題的討論和協商，提出作戰的主張和建議，比如戰爭的主要形式是利用進行火攻等等，諸葛亮很可能參與了計謀。至於像《三國演議》上所描寫的“舌戰群儒”、“草船借箭”、“披發仗劍”、登壇借東風等等帶有傳奇色彩的故事，那就完全是小說家的藝術創造罷了。
以法治蜀令出必行
赤壁之戰後，劉備占有荊州不少地方，以後又從劉璋手中奪得益州，從曹操手中奪取漢中，力量發展非常快。此間，諸葛亮為劉備鎮守後方，安撫民眾，供給軍備糧草以及兵源，為蜀漢政權的建立，作出了很大貢獻。
劉備死後，劉禪繼位，諸葛亮被封為武鄉侯，領益州牧，蜀漢的政事，不論大小，都由諸葛亮一手處置，實際上諸葛亮已成了蜀漢政權的主持者。
“內修政理”是諸葛亮在《隆中對》中提出的策略步驟，在劉備集團跨有荊州、益州、漢中，諸葛亮負責治理西蜀之後，這個問題就提到了議事日程來了。
為了維護劉備集團在益州的統治，為了蜀漢政權的長治久安，諸葛亮首先把實行法治擺在“內修政理”的首位。這是針對益州當時“亂”的局麵而采取的強有力措施。
益州原來的政治狀況很不穩定。在劉焉、劉璋統治益州時期，法令鬆弛，政治腐敗，地主豪強和官僚專橫自恣（zì），侵奪百姓，魚肉人民，因而階級矛盾非常尖銳。在公元188年，即劉焉擔任益州牧之時，就曾經發生了以馬相等為首的農民起義。起義雖然被鎮壓，但階級矛盾並沒有緩和，縱容豪強官僚欺壓、侵淩百姓的局麵還是愈演愈烈。
這種嚴重的“亂”的局麵，勢必大大不利蜀漢政權的穩固。嚴厲打擊豪強的不法行為，就是諸葛亮解決“亂”的一個重要手段。而益州地方的土著豪強，正是諸葛亮要著力打擊的對象。
諸葛亮以法治蜀的思想內容，具體體現在他主持製訂的《蜀科》的法典上（今丟失）。在《蜀科》上的相應條文，規定了對蜀土著豪強采取抑製並打擊的措施。而在實踐上，諸葛亮也執法嚴明，依法行事，不避權貴，不徇私情，刑罰有準，輕重比較適當。如對破壞法紀的蜀中豪強彭羕（yng），堅決鎮壓，毫不留情；對以私廢公、放肆專權的李嚴、廖立等，繩之以法，該罷官的罷官，該刑罰的刑罰；對挑撥是非、妖言惑眾的來敏，堅決予以革職。這些典型事跡，顯示了諸葛亮執法如山、鐵麵無私的政治家作風。相反，對於嚴明奉法、法廉自持的官吏，如蔣琬（wǎn）、費禕（yī）等，則大加褒揚、提拔。