肥胖與許多慢性病的發病率或死亡率增加有關，控製肥胖症是減少某些慢性病發病率和病死率的關鍵因素。作為危險因素，超重或肥胖對不同的慢性病影響程度不同。
肥胖與疾病
1.空腹血糖調節受損（糖尿病前期）肥胖與2型糖尿病身體超重、肥胖和腹部脂肪蓄積是2型糖尿病發病最重要的危險因素。肥胖者的胰島素受體數減少或（和）有受體缺陷，出現胰島素抵抗（胰島素敏感性下降）現象，表現為胖人空腹胰島素水平增高。肥胖是糖尿病的一個重要預測因子，我國24萬人群數據的彙總分析顯示，超重者的2型糖尿病發病率為體重正常者的2倍，肥胖者的2型糖尿病發病率為體重正常者的3倍。另有研究報告指出，與體重穩定的女性相比，18歲以後體重增加5～7.9千克的女性，糖尿病的患病危險增加1倍；體重增加8千克，危險增加2倍；相反，體重減少5千克以上的女性，危險下降一半。
中心型脂肪分布（腹部脂肪堆積）比全身型脂肪分布的人患糖尿病的危險性更大。男性和女性腰圍分別為≥85cm和≥80cm時，糖尿病的患病率為腰圍正常者的2～2.5倍。另外肥胖持續的時間越長，發生2型糖尿病的危險性越大。兒童青少年時期就開始肥胖還有18歲後體重持續增加者患2型糖尿病的危險性更大。
2.肥胖與心血管疾病
超重和肥胖有個特點，即肥胖者往往伴有多項心血管危險因素。肥胖和其他心血管病危險因素（包括高血壓、高血脂和糖尿病）之間有確切的流行病學聯係。超重、肥胖的個體，有2個及以上危險因素者動脈粥樣硬化的患病率分別為體重正常者的2.2和2.8倍，動脈粥樣硬化是冠心病、腦卒中和外周血管病共同的病理基礎，因此不難理解為何肥胖和超重在極大程度上增加了心血管病、腦卒中的危險。此外，肥胖、超重使脂肪組織過多，加重心髒負荷（包括心肌內外脂肪沉積引起的心肌負荷加重）等因素可導致或加重心髒缺血及冠狀動脈側支循環削弱或不足。
我國10項前瞻性研究顯示，體重指數增高是冠心病發病的獨立危險因素。冠心病事件（指急性心肌梗死、冠心病猝死和其他冠心病死亡）的發病率隨體重指數的上升而增高。研究人員曾對100萬例健康人隨訪16年，結果顯示，超重使心血管病死亡增加1.5倍，肥胖使心血管病死亡增加2～3倍。
3.肥胖與高血壓
隨著體重指數（BMI）的增加，收縮壓和舒張壓水平也增高，因此肥胖者的高血壓患病率增高。同時肥胖持續時間越長（尤其女性）發生高血壓的危險性越大。在控製飲食和增加運動使體重降低時，血容量、心排血量和交感神經活動會下降，血壓也隨之降低。超重和肥胖引發高血壓的機製可能與胰島素抵抗代謝綜合征有關。
4.肥胖與肺功能障礙
法國國家健康與醫學研究所對12萬法國人的健康狀況進行調查後發現，腰部肥胖的人肺功能比其他人差，可能是因為腰間的贅肉占去了部分肺部擴張的空間，也可能是因為脂肪細胞有促進呼吸係統炎症的作用。嚴重的肥胖可以引起肺心病、下肢水腫、肝大等右心衰竭症狀。
5.肥胖與高脂血症
甘油三酯別名“中性脂肪”，無論液態油還是固態脂肪其基本化學結構都是甘油三酯。肥胖是脂肪堆積的結果。甘油三酯高，說得直一點，就是血中“油”多，故不難理解很多胖人有高甘油三酯症。肥胖症患者多在餐後較長時間內血脂持續在較高水平，這說明肥胖者高甘油三酯症的原因，不僅與引致肥胖的油膩進餐有關，而且與肥胖者脂肪代謝功能異常有關。
在佛明漢研究中，體重每增加10%，血漿膽固醇相應增加0.3mmol/L（12mg/dl）。20～75歲的超重美國人高膽固醇血症的相對危險是非超重者的1.5倍，20～45歲超重者，是非超重者的2倍。超重和肥胖者的“好”膽固醇（高密度脂蛋白膽固醇）分別比體重正常者低1.8倍和2.1倍。