1939年2月4日，竺可楨對一年級新生作了《求是精神與犧牲精神》的講話，深刻、精辟地闡述了“求是”的涵義“所謂求是，不僅限為埋頭讀書或是實驗室做實驗。”而要有“殺身成仁”、“舍生取義”的精神，要有刻苦耐勞，富於犧牲的精神，“憑自己之良心，甘冒不韙”，以使“真理卒以大明”。“求是”就是追求真理、堅持真理，不惜為真理而獻身，提出要“排萬難冒百死以求真知”。他列舉布魯諾為了真理被燒死在十字架上；伽理略年近古稀還要被迫認罪；達爾文、赫胥黎不懼為舉世唾罵等。但是他們有那不屈不撓的求是精神，終能取得最後勝利。“君子蓋有舉世非之而不顧，千百世非之而不顧者，亦求其是而已矣，豈以一時之毀譽而動其心哉，此為我校求是精神之精義。”“求是”乃成為浙大之校訓。
竺可楨講話後的第二天，日軍18架飛機在浙大的臨時校舍投下118枚炸彈。
確立“求是”為校訓後，竺可楨特請馬先生作校歌，馬一浮欣然從命，他根據大學的使命特點和校訓創作了“大不自多”校歌。此歌分三章。首章說明國立大學之精神；次章說明國立浙江大學之精神，發揮校訓“求是”兩字之真諦；末章說明國立浙江大學現在之地位，及其將來之使命。歌的核心乃“昔言求是，實啟爾求真”。馬一浮作的這首歌詞，因為引用了較多的古典，用的是文言文，不太通俗。竺可楨總覺該歌詞詰屈聱牙，不甚順口，擬請豐子愷先生另寫，但豐子愷當年在浙江第一師範就讀於李叔同門下的時候，就常常跟隨李叔同到馬一浮處聽他談哲理和佛學，因此，以馬一浮之詞為妙，不願作詞。1941年6月，竺可楨致函著名作曲家、當時國立中央音樂學院的應尚能教授，請其試為該詞譜曲。同年8月7日，應尚能教授完成譜曲的工作，並寄給浙大。稍後三日，由湄潭二學生將該曲取出，並定於次日的音樂會上演唱。8月10日，在湄潭浙大附中禮堂，由“回聲”歌詠隊員演唱該曲。竺可楨聽後嫌其太長。8月14日在遵義，竺可楨召集各院院長及塗長望、黃羽儀、張藎謀、蘇步青、王勁夫、新聘之金城、豐子愷、邱仲廉及學生代表虞承藻等審查校歌，由“回聲”“大家唱”“海韻”三隊隊員八九人演唱，計先後唱三次，全歌需時約三分鍾。校歌共分三段：自“大不自多”至“爾聽斯聰”為第一段，“國有成均”至“嗟爾髦士、尚其有聞”為第二段，“念哉典學”至“天下來同”為第三段。竺可楨聽後感到太長，擬取其第二段或二、三兩段，但多數到會者認為該曲為一整體，從詞意到曲調均不能分，故仍維持原狀。並經校務會議通過，正式定為浙江大學校歌。
1940年初，浙江大學遷到了遵義。浙大理學院、農學院和師範學院的理科，落戶在距遵義75公裏的湄潭縣城文廟。至此，浙大首遷浙江建德、繼遷江西吉安與泰、廣西宜山，終至貴州遵義、湄潭，曆經四站，曆時三年，行程達五千多裏。浙大師生創造的文軍長征，可謂是中國高等教育史上的壯舉。從此，浙江大學在貴州堅持辦學6年半，凝聚了一批著名教授和愛國學生，保住了一大批著名的科學家，為中國科技發展做出了巨大貢獻。
在湄潭辦學期間，由於胡剛複的努力，事必躬親而嚴格認真，使浙大理學院迅速進入興盛時期，辦得很有特色。當時理學院各係不但教學工作出色，科研工作亦蓬勃開展，各係每周均有科學報告會。為了提倡認真讀書和科學家獻身科學的求是精神，胡還親自向全校師生作報告，講述伽利略、牛頓、法拉第、麥克斯韋等科學家的科學思想和貢獻、探索自然規律的求是精神和偉大的人格，並諄諄教誨學生學習他們不畏強暴、堅持科學真理的偉大精神。胡認為一個大學有義務向周圍社區傳播科學文化，遂向當地群眾播下科學種子和普及科學知識，鼓勵各係推廣科研成果，要求各係必須於校慶時向民眾開放實驗室，安排各種科學實驗，以豐富直觀的自然現象和認真的講解使群眾了解科學和運用科學。在浙江大學期間，胡剛複還特意為理科各係學生開設了一門“高等物理學”以加深本係和外係學生對物理學的認識，培養學生對邊緣科學的興趣。
胡剛複與竺可楨意見一致，認為要成功辦學首先要延聘高水平和愛護學生的優秀教授。此後在浙江大學遷到貴州遵義、湄潭的6年中，原有教授都安心教學科研。胡剛複還增聘了數學係蔣碩民、徐瑞雲，物理係盧鶴紱、丁緒寶，化學係王葆仁、張其楷，生物係羅宗洛、仲崇信、江希明等教師，陣容大為增強。其次，他認為要有優良的圖書、儀器設備，方能請到好教授。當時王葆仁辭去同濟大學理學院院長來浙江大學任化學係主任，就是因為浙江大學化學係的研究條件好，理學院各係圖書、設備也都很好。
而隨著梅光迪的到任，張蔭麟、胡剛複、王煥鑣，前東大學生郭斌和（白璧德弟子）、張其昀、陳訓慈等亦相繼抵達，加上劉節、錢基博等新聘人員，“學衡派”的陣地已遷移至浙大。郭斌和掌中文係，邵祖平與焉，時吳宓幾欲受聘浙大，不能行，其聞新文學派之豐子愷任職浙大，朱光潛說彼向之請教教授新文學，吳至大受刺激；外文係則梅光迪主持；史地係則張其昀、張蔭麟、錢穆等，人事如此，則發揚“學衡精神”，有“大一”要上古文課，文、師學生要上文選課，郭斌和還將所有白話作文一律不及格處理，至當時中國“三大中學”之一的浙大附中畢業高考，因而大多轉往北大、清華而盡避浙大及中央大學。當時文學院知名教授若錢穆、錢基博、繆鉞、豐子愷、王駕吾、向達、孟憲承、陳樂素、鄭曉滄、張其昀、賀昌群、夏鼐、郭斌和、黃翼、孫大雨、費鞏、吳定良、浦薛風、王庸、劉節、田德望等等濟濟一堂，可謂星漢燦爛。