不過也有學者認為慈安為“自然死亡”。徐徹的《慈禧大傳》則傾向於“病死”說。首先，作者認為慈安不善理政，例如召見臣子時說的話分量不足，隻會詢問其身體狀況、行程遠近等等，所以她根本不會妨礙慈禧在政治上的權力，慈禧也沒必要害死她。
徐徹提出了翁同龢的《翁文公恭日記》中的關於慈安發病的兩則記載作為證據。一則是慈安太後26歲時曾經患了“有類肝厥”疾病長達24天，甚至達到“不能言語”之程度。另一則是同治八年（1869年）十二月初四日，慈安太後“舊疾發作，厥逆半時許”。“厥症”主要表現為突然昏迷、不省人事、四肢厥冷，輕者昏厥時間較短，重者則會一厥不醒甚至死亡。
但這也隻是徐徹的一家之言。“東太後之死”成為了清官的又一大疑案。
慈安死後，對於慈禧而言，為其專權掃清了道路。盡管慈安生前清心寡欲，極少參與政治，不像慈禧那樣有謀略和魄力，然而慈安的存在本身，對慈禧的專權就是一股巨大的威懾。有慈安在，慈禧就不敢那麼明目張膽、恣意妄為。慈安一死，權力盡歸西宮，慈禧可以惟我獨尊、專執國政而無所忌憚。從此兩宮垂簾格局變為西宮獨尊，光緒帝還未成人，慈禧大權獨攬，開始成為名副其實的清王朝的最高統治者。
慈安的死，無疑也使奕訴在最高統治集團中少了一個可以依靠的同盟。多年來，慈安和奕訴與慈禧之間均有矛盾，奕訴多以“嫡庶之分”為由，通過支持慈安壓製慈禧的囂張氣焰，慈安也多倚重和信任奕訴，無形之中，奕訴和慈安形成一種聯合力量，來共同對付慈禧。慈禧感到勢單力薄，也在努力培植自己的勢力，在內務府、軍機處相繼安排自己的人或者是牽製奕勢力的人。慈安在時，盡管奕訴屢受打擊，但因慈安的倚重，他依然能保住軍機處的位子，執掌軍機處大權；慈安一死，形勢大變，慈禧不再受約束，同時由於自己的黨羽勢力大增，消長之間，她對奕訴也就不再顧忌了，奕訴的勢力也就更加削弱了。
東太後死後，慈禧不僅在實質上、而且在形式上也已經登上了權力的頂峰。從此以後，她被稱為“老佛爺”，完全由她一人控製了清王朝。此後，她為鞏固其“獨尊”的地位，更加深了對光緒帝的馴化和控製。
東太後慈安的突然離世，對年僅十歲的小載湉來說無疑是一個強烈的刺激。他幾乎每天都到東太後停靈的弘德殿致祭。一個多月後再人書房時，仍“尤少尤分心”，“神倦氣浮”。即使是慈安辭世三個月後，“讀雖佳而氣不靜，言及慈安大故，泫然流涕，此發於真誠者矣”。年少的光緒帝，隨著宮中唯一可體驗母愛的“調護”者的消失，使得他失去了一個有力的同情者和保護者，他的處境更加不利了。
4．“親政”
按照中國古代宮廷的慣例，皇帝十四歲就應該親裁大政了。清朝也延續了這一慣例，無論是六歲登基的順治帝，還是八歲登基的康熙帝，都在十四
歲親掌朝政。然而，到了同治帝，就像清朝本無“母後垂簾”而慈禧仍然能將“垂簾聽政”實施下去一樣，什麼“慣例”、什麼“祖製”，慈禧都能找到打破的借口。同治帝直到十六歲（同治十二年正月）才得以親政，除了因為同治帝“學識俱劣”和一些不盡如人意的客觀實情之外，慈禧戀棧皇權、不願撤簾歸政才是問題的根本所在。
光緒十年（1884年），光緒帝14歲時，因有同治帝16歲才正式親政的“新例”，所以光緒帝的親政問題沒有人敢於提及，且慈禧獨自掌權的欲望已經被朝廷上下心知肚明，因此無形之中，人們隻好把光緒帝親政的希望放在16歲上。
光緒十二年（1886年），光緒帝16歲了，親貴王親、文武大臣，甚至慈禧本人也不得不承認，無論按禮法、祖製，還是光緒帝的“學識德業”，似乎都沒有了繼續拖延的理由。早在十二年前，慈禧強立不足四歲的載湉為帝。為了籠絡人心，慈禧曾經公開做出兩項保證：（1）待光緒帝生子即為同治帝立嗣；（2）一俟皇帝典學有成，即行歸政。
光緒十二年（1886年）六月初十日，慈禧皇太後懿旨：“前因皇帝衝齡踐祚，一切用人行政，王大臣不能無所稟承，因準廷臣之請，垂簾聽政。本日召見醇親王及軍機大臣、禮親王世鐸等，諭以自本年冬至大祀圜丘為始，皇帝親詣行禮，並著欽天監選擇吉期，於明年舉行親政典禮。”
光緒十三年正月十五日（1887年2月7日），是按照慈禧的授意，由欽天監擇定的大吉之日。這一天，在太和殿要舉行光緒帝“親政”的大典。禦前太監在丹陛上鳴鞭三下，上千名官員在丹陛和廣場上如同潮水一樣起伏跪拜。端坐在寶座上的皇帝精神煥發，神采奕奕，一舉一動都顯得少有的幹淨有力。《翁同龢日記》記載道：“仰瞻天顏，甚精采也！”盡管這不過是一場名不副實、掩人耳目的“歸政”騙局，但這個儀式畢竟還昭示著有個皇帝的存在，而且不僅僅是存在，還是個長大的有獨立思想的成年人。白從二十八年前鹹豐皇帝死後，大清帝國一直沒有男主人。人們一直堅信，“牝雞司晨”隻是萬不得已的變通，男人永遠比女人更適合當家主政。人們有理由期待他會如同他那些偉大的祖先一樣，有能力帶領大清擺脫困境，重現康乾時天下太平、萬國來朝的榮光。但是從太和殿親政大典時起，光緒帝就被慈禧掌控在手裏，或被慈禧作為顯示威嚴的權杖，或被慈禧看做禦座上的玩偶。慈禧規定，每隔一日，光緒必須親白向她奏報政務，聽候訓示。光緒經常披星戴月，往來奔波。遇有重大事情，更得隨時請旨。名為皇帝，實則傀儡。光緒臨朝親政後，慈禧表麵退居頤和園頤養天年，實際上權勢依舊，仍把持著國家政務，處處限製光緒的權力，國家大事都要秉承她的懿旨去辦理。